El primer dato que se tiene acerca del poblado de Chichimilá "Agua donde está el chechem ", es un documento en el que se menciona que en este sitio existía una Encomienda a favor de la Sra. Micaela Alcocer y tenía como pensionistas a don Manuel Argaís y Noguera y a doña Juan de Argaís y Noguera. Declarada la independencia de Yucatán y su posterior anexión al resto de la República Mexicana (1821) Chichimilá queda integrado al partido de Valladolid. Posteriormente, en 1875 Chichimilá es erigida cabecera de una municipalidad perteneciente al partido de Valladolid.Al igual que muchas poblaciones del oriente del estado Chichimilá es tomado por asalto durante el conflicto denominado "Guerra de Castas ", que se verificó a mediados del siglo XIX